Perpustakaan adalah salah satu sumber ilmu bagi siswa. Berbagai macam ilmu dan pengetahuan bisa dipelajari dengan referensi buku. Untuk itu, SMP Negeri 3 Yogyakarta memperhatikan ketersediaan buku di perpustakaan.
Perpustakaan SMP Negeri 3 Yogyakarta adalah salah satu perpustakaan yang terbesar dan terlengkap untuk ukuran sekolah di provinsi yogyakarta. Berbagai macam buku dari berbagai disiplin ilmu tersedia di perpustakaan.
Siswa cukup datang ke perpustakaan, dan boleh mengakses dengan menunjukkan kartu anggota perpustakaan. Hubungi petugas perpustakaan jika memerlukan bantuan
