Ekstrakurikuler

Ekstrakurikuker yang ada di SMP Negeri 3 Yogyakarta adalah sebagai berikut

1. ESC (English Speaking Club)

2. Paduan Suara

3. Band

4. Tae Kwon Do

5. Jurnalistik 

6. Basket

7. PMR

8. KIR

9. Tonti

10. Bulu Tangkis

11. Seni Tari Tradisional

12. Karawitan